Page 42 - GENOPOLE - Rapport d'activité 2018

L'ACTUALITÉNEWS FROM THE PLATFORMS
DES PLATES-FORMES
AND INFRASTRUCTURES
• The EvryRNA software platform expanded its capacities with three new bioinformatics tools for the analysis and prediction of non-coding RNA structures. Biologists are discovering the importance of these molecules, in terms both of diversity and function. Non-coding RNA are involved particularly in adaptation to environmental changes as well as in the development of organisms and certain pathologies. EvryRNA's new tools may reveal new classes of these molecules.
• The storage capacity of the calculator at abSYNTH's synthetic biology facility was multiplied by 15 to reach 30 terabytes. Beyond that 4 teraflop calculator, the platform also offers the technical tools and software needed for the development of synthetic biology projects, from conception to completion. abSYNTH supports the research activity of its host, lSSB, the Genomics Metabolics mixed research unit and a number of start- ups in synthetic biology.
• The OCCIGEN platform was enriched by the addition of a light sheet fluorescence microscope capable of rapidly producing precise images of thick biological samples. This still rare technology will thus be available for Genopole's citizens and opportune for outside collaborations.
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• En 2018, Genopole a installé la plate-forme de Bioproduction en fermenteurs. Équipée de bioréacteurs de tailles croissantes, de 200 ml jusqu’au pilote industriel de 20 l, elle facilite la mise au point de procédés de production biologique pour des composés d’intérêt comme les médicaments, matériaux, carburants... Localisée à la pépinière d’entreprises et gérée par la société Abolis, la 29e plate- forme génopolitaine est ouverte depuis le 2 janvier 2019.
• La plate-forme logicielle EvryRNA a complété son offre avec trois nouveaux outils bio-informatiques d’analyse et de prédiction de la structure des ARN non codants. Les biologistes découvrent l’importance de ces ARN, tant par leur diversité que par leur rôle biologique. Ils sont notamment impliqués dans l’adaptation aux changements environnementaux, le développement des organismes et certaines maladies. Les outils innovants d’EvryRNA pourront révéler de nouvelles classes de ces ARN.
• La capacité de stockage du calculateur de l’atelier de biologie de synthèse abSYNTH a été multipliée par 15 pour atteindre 30 To. La plate-forme intègre un calculateur de 4 TFlops et les outils techniques et logiciels pour le développement d’un projet de biologie de synthèse, depuis sa conception jusqu’à sa réalisation. Elle supporte l’activité de recherche de l’UMR Génomique métabolique, en particulier l’équipe lSSB, et de plusieurs start-ups en biologie de synthèse.
• Un microscope à feuille de lumière a enrichi l’offre de la plate- forme OCCIGEN. Il produit très rapidement des images précises d’échantillons biologiques épais. La technologie encore peu répandue s’ouvre ainsi aux génopolitains et sera propice à des collaborations extérieures.
• In 2018, Genopole launched its new platform for fermentation-based bioproduction. Equipped with increasingly large bioreactors, from 200 ml up to a 20-liter industrial pilot, the platform will ease the development of biological production processes for compounds of interest in medicine, materials, fuels, etc. Financed by Genopole, located in the business incubator and managed by the company Abolis, this 29th Genopole platform became functional on 2 January 2019.
Genopole réunit sur son site des plates-formes techniques qui apportent des solutions concrètes aux laboratoires et entreprises du biocluster dans huit champs de recherche en sciences du vivant. Elles donnent accès à des technologies de pointe dans ces domaines et aux compétences associées. Par les services proposés ou les partenariats scientifiques mis en place, le dispositif façonné par Genopole favorise les échanges dans le cluster. Les plates- formes ont ainsi généré environ 200 interactions en 2018, dont plus de 150 ont abouti à des collaborations avec d’autres plates- formes (25%), des laboratoires (25%) ou des entreprises (50%).
Genopole deploys technological platforms to bring concrete solutions in eight fields of life sciences research to its laboratories and businesses. These platforms provide access to both state of the art technologies and the human expertise that goes with them. The platform concept imagined by Genopole, via the proposed services and scientific partnerships it enables, gives impetus to exchanges at the biocluster. To illustrate, in 2018, the platforms generated about 200 interactions, of which more than 150 led to collaborations with other platforms (25%), laboratories (25%) or businesses (50%).
NOMBRE DE PLATES-FORMES 8 PAR DOMAINE SCIENTIFIQUE*
NUMBER OF PLATFORMS
BY SCIENTIFIC FIELD* 9
Robotisation - automatisation
Robotics - Automation
Informatique - Bio-informatique
Computing - Bio-informatics
1 Bioproduction Biomanufacturing
Biologie structurale - chimie analytique
2 Structural biology - Analytical chemistry
* Certaines plates-formes opèrent
dans plusieurs domaines scientifiques.
Several platforms address several scientific fields.
5 Centre de ressources biologiques Biological resources center
12 Biologie cellulaire - Imagerie Cell biology - imaging
4 Exploration fonctionnelle 8 Functional exploration
Biologie moléculaire
Molecular biology